Fiberoskopy s przyrządami bardzo delikatnymi, wymagającymi troskliwej opieki. Żywotn$ć ich oceniana jest na okolo 2000 badań, jeśli nie mają kontaktu z promieniwaniem rentgenowskim i około 300 badań w przypadku poddawania ich działaniu tego typu promieniowania (np. w czasie choledochopankreatografii wtecznej). Fiberoskopu nie należy nigdy nadmiernie i zbędnie wyginać, chroni go trzeba także przed ewentualnym przygryzieniem przez pacjenta, gdyż każde kolejne złamane włókno szklane pozostawia ubytki w polu widzenia w postaci widocznych, coraz liczniejszych czarnych punkcików. Im większa liczba uszkodzonych włókien, tym gorsza jakość obrazu. Aby unikać zbędnego wyginania endoskopów, najlepiej przechowywać je w pozycji wiszącej w odpowiednio przystosowanych do tego szafach. Po każdym zabiegu instrument nleży dokładnie oczyścić gazą, pieluchą lub ligniną, a następnie dokładnie umy mydłem w ciepłej wodzie (nigdy powyżej 30°C). Wszystkie przewody czyci się ze śluzu i śliny przepuszczając przez nie dużą ilość wody destylowane1. Wstępnie może to być także roztwór mydła. W przypadku braku wody destylowanej można ostatecznie użyć wody przegotowanej. Do ewentualnej dezynfekcji używać można jedynie bezalkoholowych środków odkażających.